پروسه تمايز كمك خواهد كرد كه سلول‌هاي بنيادي بتوانند نقش‌هاي مختلفي را در بدن ايفا كنند. سلول‌هاي بنيادي از لحاظ توانايي تمايز به 3 دسته تقسيم مي‌شوند.

سلول‌هاي بنيادي توتي پوتنت(Totipotent) : اين سلول‌ها داراي استعداد نا محدود هستند و توانايي تبديل شدن به سلول‌هاي سازنده پرده‌هاي جنيني و تمام انواع سلول‌هاي موجود در بدن و همچنين توانايي تبديل شدن به سلولي مثل خودش را دارد مانند سلول‌هاي بنيادي جنيني اوليه.

سلول‌هاي بنيادي پلوري پوتنت (Pluripotent Stem cells) : اين سلول‌ها توانايي تبديل شدن به اكثر و نه همه بافت‌هاي يك موجود زنده را دارند مانند سلول‌هاي توده سلولي داخلي جنين در مرحله بلاستئسيست. 2 دسته سلول‌هاي بنيادي ذكر شده، سلول بنيادي جنيني گفته مي‌شود چون فقط در جنين وجود دارند.

سلول‌هاي بنيادي مولتي پوتنت (Multi potent) : اين سلول‌ها قابل تبديل و تكامل به گروهي از انواع سلول‌ها هستنند كه داراي عملكرد مشابه باشند، مثل سلول‌هاي بنيادي خونساز. به اين دسته از سلول‌هاي بنيادي، سلول‌هاي بنيادي بالغين نيز گفته مي‌شود زيرا در انسان يا جانور پس از تولد نيز وجود دارد.

منبع: جام جم